Hyperlink management system
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リンク自動管理システム(CGI)について

本サービスは、あるデータベースのIDと別のデータベースのIDとの対応関係を抽出し、 該当データベースのURLへ自動転送を行うプログラムです。*
このプログラムをHTMLに組み込むことでIDによるデータベース間のリンク管理が不要になります。
*転送先URLが複数存在する場合はリスト表示されます。

利用方法

本サービスは、
	http://biodb.jp/hfs.cgi?id=[ID]&type=[ID Type]&db=[Database name]
	
のように [http://biodb.jp/hfs.cgi?]にパラメータを渡すだけで利用できます。 設定するパラメータは以下の通りです。

  1. [ID]
    変換するIDを指定します。

  2. [ID Type]
    指定したIDの形式を指定します。
    利用できるIDのリスト

  3. [Database name]
    転送先のデータベース、ビューアーを指定します。
    利用できるデータベースのリスト

サンプル

Accession Number「BC053657」からH-InvDB (Transcript view)へリンクする場合。
	http://biodb.jp/hfs.cgi?id=BC053657&type=ACC_ID&db=TRANSCRIPTVIEW
	

HTMLには以下のように記述します。
	<a href='http://biodb.jp/hfs.cgi?id=BC053657&type=ACC_ID&db=TRANSCRIPTVIEW'>BC053657</a>
	サンプル:BC053657
	

    ID一覧
    No.形式概要
    1ACC_IDAccession Number
    2HIT_IDH-Inv transcript ID (HIT)
    3HIX_IDH-Inv cluster ID (HIX)
    4HIP_IDH-Inv protein ID (HIP)
    5UNIPROT_IDUniProt Accession Number
    6GENE_SYMBOLHUGO gene symbol
    7REF_SEQRefSeq
    8OMIM_IDOMIM ID
    9GENE_IDGeneID
    10PUBMED_IDPubMed ID
    11JSNP_IDdbSNP rs#
    12MS_IDMarker Name
    13PDB_IDPDB ID
    14FR_IDfRNAdb ID
    15ENST_IDEnsembl Transcript ID
    16ENSG_IDEnsembl Gene ID
    17CLONE_IDClone ID (by NBRC)
    18FLJ_IDFLJ ID (by NBRC)
    19HPRD_IDHPRD ID



    データベース一覧
    No.形式概要
    1TRANSCRIPTVIEWH-InvDB (Transcript view)
    2LOCUSVIEWH-InvDB (Locus view)
    3GINTEGRAH-InvDB (G-integra)
    4PPIH-InvDB (PPI view)
    5NUCLEOTIDENCBI (Nucleotide)
    6GENBANKNCBI (GenBank)
    7ENTREZGENENCBI (Entrez Gene)
    8OMIMNCBI (OMIM)
    9PUBMEDNCBI (PubMed)
    10GEMDBJGeMDBJ
    11HUGOHUGO
    12MUTATIONVIEWMutationView
    13HGOLDH-GOLD
    14PDBPDB
    15UNIPROTUniProt
    16ENSTEnsembl Transcriptview
    17ENSGEnsembl Geneview
    18GGDBGGDB
    19FRNADBfRNAdb
    20NBRCNBRC
    21HGPDHGPD
    22KEGGKEGG Gene
    23PATHWAYKEGG Pathway
    24HPRDHPRD